| Horse and Przewalski's horse mtDNA tree Build 1 (Jun 1, 2014) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Nucleotide position numbers are relative to the JN398377. Mutations are transitions unless an exact base change is specified. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coding region mutations (np 1-15465) are shown in black; control region mutations (np 15466-16657) in blue. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Mutations toward a base identical-by-state to the JN398377 are indicated with the prefix @. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| "W", "S", "M", "K", "R" and "Y" specify the heteroplasmic status of A/T, C/G, A/C, G/T, A/G and C/T at a certain site, respectively. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deletions are indicated by a"d" after the deleted nucleotide position. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Insertions are indicated by a "+" followed by the position number and type of inserted nucleotide(s). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Undetermined mutations are noted by "N". | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repetitive align region np 16126-16352 are not considered. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The length variations in the A tract scored at np 5217 (5217d), and the C tract scored at np 16404 (16404d,16404+C,16404+CC) and 16560 (16560+C, 16560+CC,16560+CCCCCCCCCCC), were not considered for phylogenetic reconstruction and were therefore excluded from the tree. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The mutations 356+T,356+TC,358d,1387A,1387G,2226+C, 2227+A,5236+A, 5237+G, 5239+A, 5241+T, 5274+G, 5277+A,15381+A,15382+C,15383+A, 15383+G and 15385+T likely due to sequencing errors in Lippold,S. et al. unpublished are not considered. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequences of Przewalski's horses are in bold for the accession numbers. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| mt-MRCA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
| A-Q | 287 725 2159 3058 3848 4306 6091 6298 7247 7477 7724 8490 9218 9401 10406 12083 12314 12626 12716 12800 13696 14023 14896 15142 @15768 15772 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| A-L | 3800 8043 8150 9086 10173 10448 11966 13920 13933 15803 @15867 16540A | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| A-K | 7900 10292 @15647 15953 16626 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| A-I | 961 3070 3942 4536 5527 7666 8358 8565 10110 11879 14803 @15823 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| ABCD | 4669 6307 8005 11842 12767 15768 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| ABC | 4646 5884 6004 10376 13049 13333 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| AB | 1387d 2788 7001 9239 10214 11543 15599 15867 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| A | 158 356 4062 11240 15647 16368 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| A1 | 15717 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| A1a | 15492 15823 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6784 | JN398377 | AP013102 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3557 12653 15629 | HQ439491 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| A1b | 16110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 778 4020 4927 8140 12545 13049 14800 14811 | JN398379 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5205T 10581 15646 | JN398380 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 331 10586 16047 | KC202957 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4520 | HQ439475 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| A1c | 16108 | JN398381 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 10764 | JN398382 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| A1d | 7181 10322 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 939 3816 16388 16541 | FJ718998 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4342 6788 12824 13104 | KC202956 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8807 | HQ439441 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15582 | JN398378 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 12773 15720 15869 16077 | AP013084 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| A2 | 16110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 260T 4017T 15599 | JN398385 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5210 | JN398384 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| A3 | 4597 13265G 15600 15669 16034 16037 16108 | JN398383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| B | 859 5929 7627 9961 10764 16052 16108 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| B1 | 15663 16110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| B1a | 15582 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| B1a1 | @5929 13816 15807 @16108 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7946 | JN398388 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2794 13541 16077 | JN398387 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15867 | JN398386 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7612 8110 | KC202959 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7204 9570 11896 11942 11951 13502 16653-16657d | HQ439458 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4245 11399 13166 | HQ439469 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4230 | HQ439488 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| B1a2 | 141+T 4482 4743 10728 11726 14689 | JN398389 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| B1b | 10832 11615 14908 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 150 | JN398390 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 16076 | KC202958 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| B1c | 4743 14689 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1896 11375 16398A | HQ439474 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 669 4062N 12314 12332 16368N | HQ439460 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 13741 | HQ439486 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| B1d | 4743 7706 11113C 14689 | AP013090 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| B2 | 9681 10144 @15823 | JN398391 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| C | 957 2238 3800 4599 4884 4993 5500 6076 7942 9664 10217 11046 11129 12352 13079 15953 15971 16110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| C1 | 9278 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| C1a | 8723 | HQ439449 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7247 12404Y | JN398394 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @6076 8279 14943Y 15227 16004 | JN398395 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 10052 15725 | JN398392 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2307 | JN398393 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5914 15582 | HQ439471 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| C2 | 267 15594 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| C2a | 7829 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 163+T 15648 @16368 | JN398397 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7811 8161 12806 15876 | HQ439487 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3975 @4599 14656 15582 15767 16108 | JN398396 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| D | 1694 2217 6532 8867 9402 11417 11457 12191 12218 12791 13948 14200 14825 15518 @15647 15734 15767 @15823 16108 16110 16391 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| D1 | 5497 15807 16084 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| D1a | 3557 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| D1a1 | 15981 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15715 | JN398399 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 13589 @14825 | HQ439489 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| D1a2 | @14825 | JN398400 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| D1b | 15593 15865 | JN398398 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| D2 | 287 2188 3412 7982 8110 9384 11690 12785 @14825 15614 | KF038162 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 10631 | KF038164 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| E-I | 4830 13502 16110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| E-G | 382 387 5830 8037 9669 10471 12860 14350 15539 15663 @15823 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| E | 278 1134 2938 4969 8352 9331 10400 10686 12653 12832 13259 14206 14908 15582 15594 15953 15971 16641 | JN398401 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| F-G | 416 2940 3576 11165 14626 14734 @15768 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| F | 3371 3562 7504 7746 8789 11820 13042 15592 15865 @16110 16511 | JN398402 | JN398403 | AP013095 | HQ439484 | AP012267 | ||||||||||||||||||||||||||||
| G | 222 3053 5498 5881 6688 9402 9741A 11552 13223 15632 15700 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| G1'2'3 | 15594 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| G1 | 5669 15582 16028 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| G1a | 14651 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 16084 | JN398404 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15612 | JN398406 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 725 8043 12794 | JN398405 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2775 2788G | EF597513 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3416 4842 7769 | JN398407 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 13812 15297 @15594 @15700 15971 | HQ439472 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1603 8230 13079 @16028 | HQ439468 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9218 16004 | HQ439479 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| G1b | 14476 14825 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7831 11453 | HQ439454 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3513 6097 14473 16368N | HQ439481 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| G2 | 9195 | JN398408 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| G2a | 8286 8361 12161 13118 13589 @15647 16077 @16110 | KC202963 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 16056C | KC202967 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5998 15020 15030T | KC202966 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9304 | KC202965 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| G2b | 638 3307 | JN398409 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| G3 | 7687 @11543 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| G3a | 9145 16028 | AP013099 | AP013083 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| 12209 12546C | AP013096 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5777T | AP013081 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 14726 | AP013085 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 12209 | AP013097 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 14107G 15971 | AP013086 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 565R 4399 5392 8174 9145 15139 15744 15953 | JN398410 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3557 4565 4673 6355 9975 14929 16028 | JN398411 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 11210 13175 14158 @14350 | HQ439443 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| G4 | 5723 11210 13328 14158 15868 | JN398412 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| H-I | 10083 13761 15582 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| H | 1546 1668 3064 4182 5272 6076 6127 6565 6835 7093 7111 7258 8481 8741 8763 8776 9209 9856 10914 14335 15004 15381d 15523 15537 15646 @15647 15715 @15823 15971 16078 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4394 8618 15803 16641 | JN398413 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7814 8489 | KC202968 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1546N 15381d 16108 16657d | HQ439490 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 961 1375 2607 3517 3942 4536 5527 5815 7516 7666 7900 8058 8301 8319 8358 8403 8565 9750 9999 10110 10292 10421 10613 11693 11879 12119 12200 12896 12950 13520 13996T 14803 15313 @15492 15531 @15715 15868 15953 16065 16077 16100 16403d 16626 | KF038166 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I | 1587 1791 2614 2770 4063 4392 5061 5210 6175 6247 8358 8379 8792 9948 10238 11827 12443 12683 14554 15535 15706 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I1 | 13466 14038 @15867 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I1a | 3160 @15647 15971 16119 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I1a1 | @16110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4936 5276 @11240 13927 15993 | JN398415 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @15823 | AP013088 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8230 13394 | JN398416 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I1b | 10699 15594 @16110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8756 9708 | JN398414 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4045 9720 @15582 16119 | AP013094 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 10699 10793 15594 16119 | HQ439476 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I2 | 9694 12404 15971 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I2a | 16436 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I2a1 | 15581 16077 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I2a1a | 16119 | JN398417 | KC202969 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| I2a1a1 | @16436 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @16368 | KC202980 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 16626 16631d | KC202984 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @16110 | KC202982 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 10062 10089 10095 10173 12653 @15823 | KC202979 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @16110 | KC202970 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @2614 14803 15815d | KC202977 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I2a2 | 12633 13720 @15582 15593 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I2a2a | 16473 | KC202973 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| I2a2a1 | 16119 | KC202975 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5220G | KC202976 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3568 | KC202981 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @13333 @15823 @16110 | KC202974 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9304 16119 16631d | KC202978 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I2a3 | 16108 | KC202971 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| @15823 | KC202972 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1606 16119 | HQ439499 | HQ439497 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| I2a4 | 16119 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8187 9251 @15582 15593 | HQ439463 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15648 | HQ439496 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4T 287 @15582 15594 15960 | KF038161 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| I2b | 4290 8074 12725 15100 16119 | HQ439480 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| JK | 1155 2863 3963 4296 4332 4608 6388 6877 7057 7201 8082 8442 9071 9396 10217 12332 13229 13336 13948 14395 14551 15804 15868 16068 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| J | 160 384T 2263 4188 4785 6472 7576 8289 9248 11081 11821 11933 13124 15582 15601 15824 16108 16641 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| J1 | 1243 3283 4782 6283 8545 10277 15529d @15647 16110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1520 | JN398418 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4C 287 1427 6658 13696 @15601 | KF038163 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| J2 | 404 881 4960 6865 13065 13325 13559 14825 15529d 15597 15992 16024 | JN398419 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| K | 2803 3283 3364 3424 4893 5569 5695 8075 8585 8631 8660 9393 9792 10415 11000 11850 12707 14175 15010 15171 15227 15541 15632 15680 15683 15772 15953 | JN398420 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| L | 1375 2899 @3070 3517 5815 7516 8058 8301 8319 9951 10421 10613 11693 12119 12200 12896 12950 13520 14995 15313 15491 15493 15531 15582 15600 15646 15868 15971 16065 16100 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L1 | 11682 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L1a | 9684 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L1a1 | @15582 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L1a1a | 16398A | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8142A 13040 | HQ439446 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 14252 | HQ439451 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 10956 16091 | HQ439483 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7001N 16084 | HQ439482 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15824 | JN398421 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 11783 14789 16077 16631d | KC203002 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L1a2 | 10982 13040 | JN398425 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| L1b | 8172 14359 @15582 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L1b1 | 8361 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @8005 | JN398422 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3379 | HQ439498 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6064 13484 | JN398423 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L1c | 2477 4901 15601 @16626 | JN398424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| L2 | 2607 @15599 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L2a | 8403 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L2a1 | 13785 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L2a1a | 5500 5932 8481 12671 14029 15682 @16065 | JN398426 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| @1387d 4646N 16398A | HQ439494 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3557 13265 | JN398427 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 13391 16028 | JN398428 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4557 15594 | AP013091 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L2a2 | 8199 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L2a2a | 14825 | KC203006 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 14252 16034 | JN398429 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1837 16398A | HQ439452 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6619 15601 16398A 16649 | HQ439492 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L2a2b | @16065 | KC203009 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 16388 | KC203018 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 575 2289 6298 | AP013079 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 10051 15530 | JN398430 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 1521 4062N 4536N 5527N 8565 9716 16368N | HQ439459 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 180 @15582 16398A 16657d | HQ439493 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287 9999 @15491 @15492 @15493 16403d @16626 | KF038165 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L2b | 3727 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L2b1 | 15824 16108 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L2b1a | 10087 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L2b1a1 | 15475 | KC203008 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4757 | HQ439470 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @15971 | KC203017 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @16626 | KC202988 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 16631d | KC202994 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L2b2 | 12494 16398A | HQ439461 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| L3 | 77 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L3a | 15601 16553 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L3a1 | 11084 16108 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L3a1a | 15529d | KC203010 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| L3a1a1 | @8565 13016 15133 15861 | KC202990 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| @12200 13466 | KC202998 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @16100 @16108 | KC203014 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9304 @16368 @16553 | KC203021 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2799 15824 | JN398433 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 12314 | KC202995 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L3a1b | 13164 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L3a1b1 | 3220 | KC203013 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| L3a1b1a | 14231A | KC203016 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| @11084 | KC202989 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4201 | KC202985 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2339 @16368 | KC202986 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9342T @9951 9961 @10110 @16553 | KC202993 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @12119 | KC203004 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9304 | KC203020 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L3a1b2 | @3517 3568 7324C 7325 12763T 14231A | KC202992 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| L3a1c | 3557 12398 16110 @16553 16554 | HQ439456 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| L3a2 | 16554 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7840 9398 14825 @15582 16654-16657d | HQ439453 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7202T 11288 @16368 @16553 | HQ439473 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 2940 7206 16078 | JN398434 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15571 16110 | JN398432 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L3b | 3557 @12950 15530 @15599 16108 | JN398431 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| L4 | 8307 12314 14659 15601 16110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L4a | 1459 | KC202996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| @13520 16631d | KC202999 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @5884 @16368 | KC203003 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 10456G | KC203005 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 12404 @12896 | KC203012 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @12314 16398A | HQ439478 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @10292 16631d | KC202987 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| L4b | @16368 @16626 | KC203001 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| M-Q | 4605 5827 6712 8076 8238 8556T 10859 11394 11492 12332 13629 14626 15342 16118 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| M-N | 1609T 2339A 3475 @3942 4526 4898 6076 7432 8175 8798 9332 9540 10460 10646 12029 12095 13100 13356 13502 13615 13720 14422 14671 14815 15052A 15133 15824 15866 16065 16543 16556 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| M | 427 3100 4599G 5103 @9239 15614 15656 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| M1 | 16077 | HQ439442 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| M1a | 874 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| M1a1 | 16110 | HQ439455 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4590 9116 @14422 16134 16142 16150 | KC203024 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 14183 | JN398439 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5208 11725 11916 15700 16214 | AP013092 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5130 13966 14773 | JN398438 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 198 7523 @15656 | JN398437 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @427 4062N 4526N 4536N 7001N 9002 14183 16118N 16368N | HQ439485 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| M1b | 3211T 10515 11513 | JN398436 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| @4605 11789 | HQ439466 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 10646 11803 15582 | HQ439495 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9146 15582 15822 16077C 16110 | JN398435 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 14252 @16065 16110 16445 16468A 16485A 16495G 16504 @16556 | FJ718997 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4386 14998 @15656 16035 | AP013098 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| M2 | 11848 16511d | KC203026 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| @15803 16631d | KC203025 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @15866 15867 15868 15971 16100 16110 @16118 | KC203027 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 13317G | KC203023 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| N | 2802 3557 4917 8280 9071 9402 10404 10517 15598 15835 16004 16108 16110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| N1 | 3100 13309 13567 | JN398440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15571 15582 | JN398441 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15541 @16108 16398A | HQ439464 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| N2 | 9918 12674 13567 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| N2a | 11384 15582 | JN398443 | JN398444 | |||||||||||||||||||||||||||||||
| N2a1 | 4428 13335 | KC203029 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4218 | KC203030 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @4917 | KC203031 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 142+T 11384 @15824 | JN398442 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| O-Q | 739 860 3259T 3271 3616 6529 7243 7612T 7898 @8043 8361 8855 9775 11378 11424 12167 12230 12404 13463 15202 15700 15774 @15803 16035 16060+C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| OP | 1684C 3557 7427 9053 12287 13466 15594 15664 15806 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| O | 5821 6745 7375 8040 10361T @10448 10501 12305 12927 13951 15632 16110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 13947 14825 15601 16357 | JN398445 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 965 14650 @16060+C 16398A | HQ439467 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| P | 1383 6505 13370 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| P1 | 12314 @15594 15763 16505 | JN398446 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| P2 | 4446 13202 | JN398447 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| P3 | 339 6775 13336 13697 15601 | JN398448 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| P4 | 15601 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| P4a | @16060+C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5286 12299 | HQ439444 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 172T 9696 14193T 14825 16054 16398A | HQ439445 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 9703 | HQ439447 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 4605N 7981 12503 15992 @15594 16657d | HQ439500 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 6415 7913 16110 | AP013089 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15582 16013 | AP013093 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3800N 4646N 4669N 9753 10448N 11045 @13370 13747 13761 16118N 16626N @16060+C | HQ439457 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 142 287 542 721 1892 2739 3727 5068 5359 9696 10379 10631 13304 13696 13861 14016 14825 @15594 @15599 @16118 | KF038160 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q | 302 341 4201 7294 9203 15737 15808 16034 16054 16110 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q1 | 6688 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q1a | 10244 14825 14827 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3124 | JN398451 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 12599 13475 | JN398452 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q1b | 15723 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q1b1 | @16060+C | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q1b1a | 13307 15601 @15774 @16034 @16110 | HQ439477 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| 15866 16060C | HQ439465 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7576 9071 16060C @16110 @16118 | HQ439448 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 16062+T 16108 | JN398450 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 5824 15594 15601 15657 | JN398449 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q2'3 | 15582 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q2 | 5875 15992 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q2a | @15582 15601 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 653d 6952 @8076 @13463 15016G 16581+A | EF597514 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 854 15647 @16054 @16060+C | HQ439450 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 7060 8439 11901 16060 16060+C | JN398453 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| Q3 | 11942 13232 15601 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 855 13111 16032 | JN398454 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| @16110 | JN398455 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 287 542 1427 13020 @16118 | KF038159 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| R | 2316 2869 2887 3052 4104 4113 4275 4459 4596 4918 5378 5416 5455 5669 6175A 6412 6598 6724 6930 6947 7447 7573 7576 7912 8361 8502 8678 8969 9302T 9618 10367 10751 10886 10925 11178 11383 11614 12428 12941 13211 13214 13275T 13434 13766 14114 14825 14884 14953 15076 15106 15247 15250T 15595 15613 15656 15700 15767 15773 15824 15971 15993 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| R1 | 15612 16100 16473 16537 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3269 13402 16365 16524 | JN398457 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 8304 13256 14122 14252 16108 | JN398456 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| 11725 14908 @15595 16108 | AP013078 | |||||||||||||||||||||||||||||||||
| R2 | 12023 @16368 @16540A | FJ718996 | ||||||||||||||||||||||||||||||||